19 años en el futuro, el mundo es un mundo post-apocalíptico y es amenazado por Ross, un maligno líder con el propósito de destruir la Tierra y borrar el tiempo con la ayuda de un Tiempornado (un tornado que altera el espacio-tiempo, que crea agujeros de gusano en distintos lapsos de tiempo y destruye el tiempo poco a poco). Los guardias del parque ahora son: Benson (Comandante), Rigby (el mejor soldado), Papaleta, Musculoso y Fantasmano (como soldados de tiro).
Los guardias del futuro planean destruir el Tiempornado y así salvar el mundo, pero esto se sale de sus manos cuando llegan a donde éste se encuentra y son emboscados por Ross y su mano derecha: Mordecai del futuro. Mordecai del futuro mata a sus antiguos amigos excepto Benson y Rigby del futuro, quienes se ocultan. Benson del futuro se sacrifica mientras Rigby del futuro toma una nave/máquina del tiempo para volver al pasado cuando iba junto con Mordecai en la secundaria, mas Mordecai del futuro le sigue en otra nave y ambos se disparan mientras Rigby del futuro, herido, viaja a una época menos distante para encargarle el trabajo a alguien más: el presente.
En el presente, Mordecai y Rigby actuales beben café de Eileen tras comprar tacos y corren al parque llegan tarde al trabajo y Benson quien los despedirían, pero Rigby lo engaña y le dice que esos tacos eran para Benson y por eso llegaron tarde. Benson los perdona y sigue el día normal hasta que la nave del Rigby del futuro cae en el parque. El equipo llega a ver y encuentran a una versión más madura pero moribunda de Rigby, quien les cuenta sobre el futuro del que viene y su misión de destruir el Tiempornado; Rigby futuro le dice a Mordecai y Rigby que arreglen el único problema que no han arreglado: su antiguo proyecto y le suplica a Rigby que esta vez diga la verdad y no cometa el mismo error que él. Segundos luego, el Rigby del futuro muere y el equipo decide investigar.
En la casa, Mordecai y Rigby les explican a sus amigos que cuando iban a la secundaria, Rigby no podía pasar a la universidad, así que su maestro de volleyball, Ross, les puso a hacer un proyecto de ciencias de cualquier cosa, por lo que hicieron una máquina del tiempo, la cual explotó al ser usada y el profesor Ross fue enviado a la cárcel, mientras que por alguna razón, Rigby pasó a la universidad y Mordecai no y se tuvo que quedar en una de educación superior. Los guardias deducen que el Tiempornado se originó de ahí y deciden usar la nave de Rigby del futuro e ir al pasado para impedir que sea construida esa máquina.
En el pasado, los Mordecai y Rigby jóvenes son molestados por el equipo de volleyball, quienes culpan a Rigby por haber arruinado su campeonato cuando los distrae en la última jugada porque éste practicaba con una tuba y sin querer los distrae y pierden. Mientras tanto, los guardias del presente llegan al pasado 6 años antes y Mordecai, Rigby, Benson y Papaleta se cuelan en la escuela secundaria, pero debido a que Benson y Papaleta usaron uniformes de la escuela rival, son maltratados por el equipo de Volleyball. Mordecai y Rigby jóvenes son informados por su maestro de Volleyball, Ross, que Rigby joven debe hacer un proyecto de ciencias para pasar el curso. Rigby joven pide un ejemplo, por lo que el maestro Ross les muestra un prototipo de una máquina del tiempo, la cual no está terminada y necesita plutonio 3 para funcionar, el cual el maestro Ross les enseña, sabiendo que es ilegal (que en realidad es para volver atrás y vengarse de Rigby por arruinar su partido).
En la nave, Musculoso (quien fue encargado de cuidar la nave mientras Skips va por sus herramientas el la cochera de su yo pasado) decide ir con Fantasmín al baño en un arbusto porque el baño de la nave es muy peligroso, pero mientras no está, el Musculoso y Fantasmín del pasado se roban la nave para hundirla en el Pozo de los Autos. Musculoso, Fantasmin y Skips detienen a Musculoso y Fantasmín del pasado.
Mordecai y Rigby jóvenes van a una pizzería donde hay un árcade de juegos con uno nuevo. Dos personas los retan a jugar y lo vencen fácilmente gracias a un par de años de práctica. Mordecai y Rigby jóvenes quedan extrañados, pues el juego es nuevo, pero estas resultan ser Mordecai y Rigby actuales. Mordecai y Rigby les mienten de que están para ayudarlos en su proyecto y hacen un volcán de bicarbonato en vez de la máquina. Cuando sus versiones secundarias se van, Mordecai y Rigby destruyen el prototipo de la máquina y se van, pero Ross (el del futuro) los observó todo el tiempo.
De vuelta en la nave, Rigby nota que los agujeros siguen apareciendo y se da cuenta que su yo pasado está por hacer la mentira de la que Rigby del futuro le dijo que revelara.
En la casa de Rigby pasado, a éste le llega su carta de la universidad, pero queda triste cuando resultó rechazado. Rigby pasado va a revisar el correo de su amigo y para su sorpresa, él sí fue aceptado; Rigby hace una nota falsa donde dice que Mordecai pasado también fue rechazado. Mordecai pasado le sorprende y se entristece al ver que (falsamente) fue rechazado y Rigby le miente diciéndole que él sí fue aceptado. Mordecai pasado decide ir con Rigby pasado a la secundaria en la noche, terminar la máquina del tiempo y volver atrás para advertirles a sus contrapartes y tener mejores notas. Al irse, Rigby trata de alcanzarlos, pero es detenido por Ross, quien tan solo reemplaza el prototipo destruido por otro al abrir un portal a su antigua oficina. Rigby corre con sus amigos y todos van a la secundaría, pero son detenidos por Mordecai del futuro, quien junto con Ross, disparan a los guardias. Mordecai y Rigby pasados agregan el plutonio a la máquina y Rigby pasado pone su reloj dentro a propósito, creyendo que eso le daría tiempo a la máquina.
Los guardias no logran detenerlos puesto que Ross lleva un collar que le permite a su cuerpo regresar en su propio tiempo antes de ser herido y la máquina explota, creando el Tiempornado que viaja a otra época. Ross amenaza con matar a Mordecai si Rigby no revela la verdad como parte de su plan. Rigby saca su carta de rechazo y la lee completa, lo que causa la furia de Mordecai pero no la de Mordecai pasado al tener aún posibilidades de entrar a la universidad. Ross, viendo como su plan para eliminar a Rigby esta en acción, lleva a cabo la fase 2: Matar a Mordecai. Ross le lanza una pelota-bomba, pero el Mordecai del futuro, tras ver la pena de Rigby, se sacrifica y cae moribundo, por lo que Ross se va en un portal. Rigby huye y se lleva la nave el espacio, mientras Benson, Papaleta, Musculoso, Skips y Fantasmano lo persiguen sin éxito. Los Mordecai y Rigby pasados huyen ante tales eventos, pero el moribundo Mordecai del futuro le dice a su yo presente que el trabajo no importa y que la razón por la que se unió a Ross solo fue por trabajo no por que perdió al no ir a la universidad, sin embargo, cambia de parecer y prefiere cambiarlo todo por su amistad con Rigby de nuevo, y acaba muriendo. Rigby trata de suicidarse tirándose al Sol, pero la nave tenía poca gasolina y lleva a Rigby a la gasolinera más cercana, pero al ser hiper-velocidad, Rigby se desmaya. En el parque pasado, Mordecai llega con sus amigos con una nave que su yo futuro tenía en modo invisible. Los guardias ven a un viejo Jean del ex parque rival que pide toda la ayuda posible para detener a Ross, por lo que Mordecai y sus amigos van a ayudarlos no sin antes ir al presente y pedir ayuda a Tecmo y los Bebés eternos.
Rigby despierta en la gasolinera del padre tiempo, quien le explica que se esta desintegrando gracias al Tiempornado. Rigby le explica todo y el padre tiempo le hace ver que si de verdad quiere a Mordecai, debe disculparse. El padre tiempo le regala a Rigby gasolina y éste va a la base, donde los guardias (salvo Mordecai quien fue a destruir el Tiempornado) le dejan ir con su amigo. Rigby ve distintos portales abiertos incluyendo desde cuando él y Mordecai se conocieron de bebés en guardería hasta el resto de sus aventuras que han tenido, además de ver unas horas en el pasado (de el futuro) y ve cómo los Mordecai y Rigby del futuro se disparan. Rigby encuentra a Mordecai siendo apuntando por Ross. Mordecai pelea con Ross y Rigby lo toma desprevenido y lo tira de un piso. Mordecai y Rigby se disculpan el uno al otro e intentan retirar el plutonio (la fuente de poder del Tiempornado aún), pero Ross resurge gracias a su collar. Techmo le da a Rigby una espada del estilo de Star Wars, mientras Mordecai lo ahuyenta y Rigby corta el cuello a Ross y destruye su collar. Ross cae en el Tiempornado y es desintegrado. Mordecai y Rigby tiran el plutonio en el Tiempornado y este se auto destruye.
En el pasado Frank y su joven hija, Margarita, reportan todo en el helicóptero 6 acerca de le explosión en la secundaria. El maestro Ross es arrestado por el almacenamiento de plutonio ilegal, pero no sin que antes el Rigby pasado (convencido por Rigby presente) se disculpe por arruinar su partido, lo que hace que Ross lo poderdone y no se vuelva malvado.
En el presente, Mordecai y Rigby ven como los cuerpos de sus contrapartes futuras se esfuman, lo que significa que tendrán un mejor futuro.
Al día siguiente, Benson busca a Mordecai y Rigby para reparar los daños de la nave, pero éstos se escaparon con la nave para comprar más tacos y deciden volver al parque usando el viaje en el tiempo.
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